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Factsheet: Jmol

Gruppe: Bioinformatik

Zweck: Jmol ist ein Open-Source-Java-Viewer für chemische Strukturen in 3D mit Funktionen für Moleküle, Kristalle, Materialien und Biomoleküle.

Eigenschaft Wert
Latest 16.2.31
LTS N/A
Reifegrad Stabil
Technische Schulden Gering
Erwartetes Lebensende Kein EOL bekannt
Referenzhandbuch jmol.sourceforge.net
Wikipedia de.wikipedia.org/wiki/Jmol

Installation (Ubuntu 24.04)

sudo apt update
sudo apt install jmol

Hello World

jmol -n -g 100x100 -J "load $caffeine; write image hello.png"

Beispieldaten

Die folgenden Beispieldaten befinden sich im Ordner examples/:

  • molecule.pdb
  • test.cif
  • test.mol
  • sample1.pdb
  • sample2.pdb

Validierung

Starten Sie Jmol mit einer Beispieldatei:

jmol factsheets/bioinformatik/jmol/examples/molecule.pdb