Factsheet: Seqkit

Gruppe: Bioinformatik

Zweck: SeqKit ist ein schnelles und vielseitiges Kommandozeilenwerkzeug zur Manipulation und Analyse von Sequenzdaten in den Formaten FASTA und FASTQ.

Eigenschaft	Wert
Latest	2.9.0
LTS	N/A
Reifegrad	Stabil
Technische Schulden	Gering
Erwartetes Lebensende	Kein EOL bekannt
Referenzhandbuch	bioinf.shenwei.me/seqkit

Installation (Ubuntu 24.04)

sudo apt update
sudo apt install seqkit

Hello World

seqkit version

Beispieldaten

Die folgenden Beispieldaten befinden sich im Ordner examples/:

• data.fasta
• data.fastq
• test1.fa
• test2.fa
• test3.fa
• test4.fa
• test5.fa

Validierung

Verwenden Sie seqkit für Statistiken:

seqkit stats factsheets/bioinformatik/seqkit/examples/data.fasta